El departamento de teología del IBBA se concentra en la formación de hombres y mujeres que sienten una vocación por el ministerio cristiano en sus múltiples manifestaciones. Por una parte, suple la necesidad formativa de quienes manifiestan un claro llamado al ministerio pastoral de tiempo completo o bi-vocacional. Por otra parte, capacita, entrena y forma a personas para el desempeño de otro tipo de ministerios en la iglesia de Cristo o en entidades relacionadas con el ministerio cristiano, por medio de la enseñanza, el liderazgo, la evangelización o las misiones. Lo anima la convicción de que la educación teológica es para todos los cristianos y que todo ministerio ejercido con excelencia requiere de formación específica y adecuada. Es por ello que el IBBA ofrece por medio de este departamento formación en Biblia, Teología y Ministerio Pastoral en múltiples niveles que suplen las diversas inquietudes y necesidades de quienes se acercan a sus aulas. Lo hace desde una clara postura evangélica, pero con una apertura que permite enriquecerse con las diversas expresiones y experiencias que en la actualidad expresa el pueblo de Dios en América Latina.